Interní auditor organizuje a řídí činnosti vyplývající ze schváleného plánu vnitřních auditů CKTCH a realizuje také mimořádné audity na základě pokynu ředitele. Provádí kontrolní činnost v souladu se schváleným plánem i podle aktuálních potřeb organizace.
Řediteli a vedení CKTCH předkládá analýzy, zprávy a doporučení týkající se přezkoumávaných činností a procesů. Jeho cílem je podporovat vedoucí zaměstnance při efektivním řízení a naplňování stanovených cílů organizace.
Při své činnosti postupuje v souladu s platnou legislativou, ověřuje plnění uložených nápravných opatření a zajišťuje součinnost s orgány vnější kontroly.